il titolo è un po vago.. è quasi sicuro che tu abbia l'icona messaggi che comprende tutte le casistiche (email e sms) in una unica soluzione.
le due soluzioni banali sono:

• ti metti sull'ultima data e segni tutto come letto
• entri in messaggi e cliccando la lettera U scorri i messaggi nn letti
• Fai un Reset (togliere la batteria a telefono acceso)

Se per caso fosse un BlackBerry BES potresti anche provare a riconciliare la cassetta postale..